Protein–RNA interactions for Protein: O09172

Gclm, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GclmO09172 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GclmO09172 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GclmO09172 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GclmO09172 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GclmO09172 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GclmO09172 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GclmO09172 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GclmO09172 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GclmO09172 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GclmO09172 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GclmO09172 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GclmO09172 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GclmO09172 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GclmO09172 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GclmO09172 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GclmO09172 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GclmO09172 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GclmO09172 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GclmO09172 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GclmO09172 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GclmO09172 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GclmO09172 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GclmO09172 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GclmO09172 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GclmO09172 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GclmO09172 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GclmO09172 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GclmO09172 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GclmO09172 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GclmO09172 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GclmO09172 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GclmO09172 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GclmO09172 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GclmO09172 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GclmO09172 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GclmO09172 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GclmO09172 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GclmO09172 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GclmO09172 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GclmO09172 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GclmO09172 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GclmO09172 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GclmO09172 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GclmO09172 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GclmO09172 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GclmO09172 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GclmO09172 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GclmO09172 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GclmO09172 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GclmO09172 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GclmO09172 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GclmO09172 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GclmO09172 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GclmO09172 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GclmO09172 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GclmO09172 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GclmO09172 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GclmO09172 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GclmO09172 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GclmO09172 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GclmO09172 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GclmO09172 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GclmO09172 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GclmO09172 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GclmO09172 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GclmO09172 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms