Protein–RNA interactions for Protein: L7N219

Gm5458, Predicted gene 5458, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5458L7N219 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm5458L7N219 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm5458L7N219 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm5458L7N219 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm5458L7N219 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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