Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms