Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms