Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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