Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sclt1G5E861 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sclt1G5E861 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sclt1G5E861 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms