Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms