Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms