Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms