Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms