Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms