Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm10378F6XQQ1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
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Gm10378F6XQQ1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
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Gm10378F6XQQ1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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