Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms