Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20518E9Q548 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms