Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
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Ccdc171E9Q1U1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Ccdc171E9Q1U1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Ccdc171E9Q1U1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Ccdc171E9Q1U1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Ccdc171E9Q1U1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Ccdc171E9Q1U1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Ccdc171E9Q1U1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Ccdc171E9Q1U1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Ccdc171E9Q1U1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Ccdc171E9Q1U1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Ccdc171E9Q1U1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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