Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1C7

Gm10471, Predicted gene 10471, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10471E9Q1C7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm10471E9Q1C7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm10471E9Q1C7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm10471E9Q1C7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm10471E9Q1C7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm10471E9Q1C7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10471E9Q1C7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10471E9Q1C7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10471E9Q1C7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10471E9Q1C7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10471E9Q1C7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10471E9Q1C7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10471E9Q1C7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10471E9Q1C7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10471E9Q1C7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10471E9Q1C7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10471E9Q1C7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10471E9Q1C7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10471E9Q1C7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10471E9Q1C7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10471E9Q1C7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10471E9Q1C7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10471E9Q1C7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10471E9Q1C7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Gm10471E9Q1C7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm10471E9Q1C7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms