Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms