Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Rnf217D3YYI7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Rnf217D3YYI7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Rnf217D3YYI7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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