Protein–RNA interactions for Protein: D3YWC7

Fam47e, Family with sequence similarity 47, member E, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47eD3YWC7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms