Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmf1B9EKI3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms