Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp26c1B2RXA7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms