Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpb1B2RS76 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpb1B2RS76 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpb1B2RS76 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpb1B2RS76 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpb1B2RS76 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpb1B2RS76 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpb1B2RS76 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpb1B2RS76 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpb1B2RS76 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpb1B2RS76 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpb1B2RS76 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpb1B2RS76 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpb1B2RS76 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpb1B2RS76 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpb1B2RS76 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpb1B2RS76 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpb1B2RS76 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpb1B2RS76 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms