Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms