Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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