Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc163A2AGD7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms