Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms