Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXJ7

Larp1b, La ribonucleoprotein domain family, member 1B (Fragment), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Larp1bA0A0A6YXJ7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Larp1bA0A0A6YXJ7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Larp1bA0A0A6YXJ7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Larp1bA0A0A6YXJ7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms