Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B652

Trav5-4, T cell receptor alpha variable 5-4 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav5-4A0A075B652 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trav5-4A0A075B652 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav5-4A0A075B652 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trav5-4A0A075B652 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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