Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms