Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hdac6Q9Z2V5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hdac6Q9Z2V5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hdac6Q9Z2V5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hdac6Q9Z2V5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hdac6Q9Z2V5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hdac6Q9Z2V5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hdac6Q9Z2V5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hdac6Q9Z2V5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hdac6Q9Z2V5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hdac6Q9Z2V5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hdac6Q9Z2V5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hdac6Q9Z2V5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hdac6Q9Z2V5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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Hdac6Q9Z2V5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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Hdac6Q9Z2V5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hdac6Q9Z2V5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hdac6Q9Z2V5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hdac6Q9Z2V5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hdac6Q9Z2V5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hdac6Q9Z2V5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hdac6Q9Z2V5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hdac6Q9Z2V5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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Hdac6Q9Z2V5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hdac6Q9Z2V5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hdac6Q9Z2V5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hdac6Q9Z2V5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hdac6Q9Z2V5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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Hdac6Q9Z2V5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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Hdac6Q9Z2V5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hdac6Q9Z2V5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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Hdac6Q9Z2V5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hdac6Q9Z2V5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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Hdac6Q9Z2V5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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Hdac6Q9Z2V5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hdac6Q9Z2V5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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Hdac6Q9Z2V5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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Hdac6Q9Z2V5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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Hdac6Q9Z2V5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdac6Q9Z2V5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdac6Q9Z2V5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdac6Q9Z2V5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdac6Q9Z2V5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdac6Q9Z2V5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdac6Q9Z2V5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdac6Q9Z2V5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdac6Q9Z2V5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdac6Q9Z2V5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdac6Q9Z2V5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdac6Q9Z2V5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdac6Q9Z2V5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdac6Q9Z2V5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdac6Q9Z2V5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdac6Q9Z2V5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdac6Q9Z2V5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdac6Q9Z2V5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdac6Q9Z2V5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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