Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms