Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tulp1Q9Z273 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms