Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z266

Snapin, SNARE-associated protein Snapin, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnapinQ9Z266 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SnapinQ9Z266 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms