Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms