Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cldn3Q9Z0G9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cldn3Q9Z0G9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cldn3Q9Z0G9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cldn3Q9Z0G9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cldn3Q9Z0G9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cldn3Q9Z0G9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cldn3Q9Z0G9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cldn3Q9Z0G9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cldn3Q9Z0G9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cldn3Q9Z0G9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cldn3Q9Z0G9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cldn3Q9Z0G9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cldn3Q9Z0G9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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