Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms