Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms