Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Q9

Atp6ap1, V-type proton ATPase subunit S1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms