Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms