Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gpc1Q9QZF2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gpc1Q9QZF2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gpc1Q9QZF2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gpc1Q9QZF2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gpc1Q9QZF2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gpc1Q9QZF2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gpc1Q9QZF2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Gpc1Q9QZF2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Gpc1Q9QZF2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Gpc1Q9QZF2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc1Q9QZF2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Gpc1Q9QZF2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms