Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms