Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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