Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms