Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms