Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms