Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms