Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM7

Msh5, MutS protein homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh5Q9QUM7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms