Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolkQ9QUG2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolkQ9QUG2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolkQ9QUG2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolkQ9QUG2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolkQ9QUG2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolkQ9QUG2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolkQ9QUG2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolkQ9QUG2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolkQ9QUG2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolkQ9QUG2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolkQ9QUG2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolkQ9QUG2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolkQ9QUG2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolkQ9QUG2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolkQ9QUG2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolkQ9QUG2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolkQ9QUG2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolkQ9QUG2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PolkQ9QUG2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PolkQ9QUG2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolkQ9QUG2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolkQ9QUG2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolkQ9QUG2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolkQ9QUG2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolkQ9QUG2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolkQ9QUG2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolkQ9QUG2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PolkQ9QUG2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolkQ9QUG2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolkQ9QUG2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PolkQ9QUG2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolkQ9QUG2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms