Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms