Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LitafQ9JLJ0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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