Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
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Col5a3Q9JLI2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms